李密给杨玄感出了上中下三策。
上策是袭据涿郡扼临榆关，使隋军溃散关外；中策是攻占长安，占据关中和杨广对抗；下策是攻打东都洛阳。
杨玄感认为此去涿郡辗转两千余里，粮草难以运送，且涿郡一带经过连年用兵和天灾，百姓流离失所遍地哀鸿，已经失去了发展的基础，不是最佳选择。
进攻长安也非良策，在这方面杨玄感是相当失望的，他本以为世家门阀对杨广不满，老百姓对杨广也不满，只要他举事定能一呼百应，可实际上除了余杭的刘元进、朱燮在江南起兵响应外，各地一点儿动静都没有，尤其关陇门阀，丝毫没有拥护他的意思，既然不拥护他，去长安又有什么意义？
而且从黎阳去长安千里之遥，一路关隘重重，一旦有所阻碍，自己便会陷入进退两难的境地。
因此，杨玄感最后选择攻打洛阳，第一，距离近，只有五百多里，朝廷没等调集重兵，自己就已经兵围洛阳城了。第二，只要能攻破洛阳，捉住一干重臣的家属，他们就会投鼠忌器。
而且洛阳城还有留守的越王杨桐，如果捉住他便可大做文章。另外，洛阳乃是东都，一旦有失定会动摇杨广根基，自己则也会声威大震，到那时，就会一呼百应了。
对于杨玄感的选择，李密心里极其失望，这人实在是目光短浅，世家门阀对杨广都阳奉阴违，还能瞧得上你个粗鄙武夫？不趁此机会将他们困死在辽东，更待何时？
若是一举收拾了杨广和世家门阀的中坚力量，这天下还不是唾手可得？
虽然李密也是门阀出身，可这厮心里比谁都清楚，世家门阀最是靠不住，此次正是铲除他们的大好机会，即便不能杀戮殆尽，也要趁此毁其根基，否则，即便得了天下也必为大患！杨广走到今天这一步，世家门阀绝对是主要原因。
可杨玄感经过慎重考虑还是拒绝了李密的建议，引兵从汲郡渡河，进逼东都洛阳。
可事情的发展出乎了杨玄感的意料，他没想到朝廷的反应如此迅速，也没想到还有那么多忠于杨广的鹰犬。
头号鹰犬，刑部尚书卫玄，受代王杨侑派遣，同武牙郎将霍世举、太仆少卿韩绍共领精兵七万救援洛阳。为何把他视为头号鹰犬？因为卫玄走到华阴的时候居然挖掘杨玄感之父杨素的坟墓，焚烧其尸骸遗骨，将其祖茔铲平，以此表明必死的决心。
二号鹰犬，民部尚书樊子盖，这老头有如屠夫一般狠辣，河南赞治裴弘策为杨玄感所败，樊子盖二话不说将其斩首，抓住俘虏更是一个不留，全部活埋，杨玄感全力攻打洛阳城，均被樊子盖击退。
三号鹰犬，武贲郎将陈棱在黎阳击败元务本，重新夺回黎阳仓。
四号鹰犬屈突通进驻河阳。
另外，宇文述、吐万绪、来护儿相继回师洛阳，杨玄感一见不由心灰意冷，只好听从前民部尚书李子雄的建议，放弃攻打洛阳，转而进军长安。
宇文述等人紧追不舍，最后杨玄感走投无路，在葭芦戍让弟弟杨积善抽刀砍死自己，至此，杨玄感叛乱被彻底平定。
杨广气愤难消，下令将杨玄感分尸，又把他的肉切成一块一块放火焚烧。
接着，杨广又命樊子盖严查杨玄感余党，嗜杀成性的樊子盖有了圣上旨意更加狠辣，包括杨玄感的诸弟义阳太守杨玄奖以及杨万硕、杨民行在内一口气杀了三万多人，只杀得洛阳城人心惶惶，最后众多大臣苦劝，才止住已经失控的滥杀之势。
牛秀随着吐万绪到达东都时，杨玄感的叛乱已经平定，于是杨广命吐万绪率军讨伐响应杨玄感叛乱的余杭刘元进。
吐万绪率领大军夜渡扬子津，击退了准备从茅浦渡江的刘元进所部，解除了润州之围，接着吐万绪继续进军，刘元进则命令手下朱燮、管崇等人驻扎在毗陵，他自己则率领败军撤回老巢会稽休整。
吐万绪高歌猛进，击败朱燮，斩杀管崇及其将军陆顗等五千多人，俘虏男女三万多口，送往江都宫，继而进军解除会稽之围。
刘元进率领残军据守建安郡，杨广命令吐万绪继续进军征剿，但吐万绪认为士卒连战疲敝需要整休，毕竟从辽东之战开始到现在将近一年的时间，将士没有得到一丝喘息，吐万绪上奏杨广请求息甲修整，等待来年春天再战。
杨广得到奏报心中很不高兴，于是秘密派人寻找吐万绪的过错，结果吐万绪这人还真洁身自好，没什么过错可抓，最后杨广以怯懦违诏将吐万绪削职为民。
这个理由是十分荒唐的，首次东征的时候吐万绪可是主动请缨担任先锋，攻打辽东城、进军平壤、血战萨水，吐万绪身为左屯卫大将军几乎每战都身先士卒从未退缩半步，何曾有过怯懦？
这次杨玄感叛乱，吐万绪也率军回师洛阳，到洛阳后一刻都没停留便出师讨伐刘元近，从辽东到涿郡，从涿郡到洛阳，从洛阳到余杭，从余杭又到会稽，辗转奔波将近一年的时间，行程五千余里，士兵不应该休整吗？
吐万绪心中无比失望，手下将领也都愤愤不平，牛秀更是感到心灰意冷，再次向吐万绪请辞。
吐万绪一直都很看重和信任牛秀，毕竟当初是他亲自从东平带出来的，现在自己被削职为民配守建安，牛秀任职时间短，在朝廷也毫无根基，如今想要辞归故里，吐万绪也很理解。
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